主管稅務機關應及時按有關規(guī)定辦理退稅，或者經(jīng)納稅人同意后抵繳其下一年度應繳企業(yè)所得稅稅款。

根據(jù)《企業(yè)所得稅匯算清繳管理辦法》  第十一條的規(guī)定：

納稅人在納稅年度內(nèi)預繳企業(yè)所得稅稅款少于應繳企業(yè)所得稅稅款的，應在匯算清繳期內(nèi)結(jié)清應補繳的企業(yè)所得稅稅款；預繳稅款超過應納稅款的，主管稅務機關應及時按有關規(guī)定辦理退稅，或者經(jīng)納稅人同意后抵繳其下一年度應繳企業(yè)所得稅稅款。

納稅人因有特殊困難，不能在匯算清繳期內(nèi)補繳企業(yè)所得稅款的，應按照稅收征管法及其實施細則的有關規(guī)定，辦理申請延期繳納稅款手續(xù)。